40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1654 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1654  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.773346  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  32.35 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  32.35 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  39.13 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  27.36 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  33.68 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.9 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  29.27 
 
 		 420 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  35.35 
 
 		 395 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  29.27 
 
 		 420 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  27.16 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  46.67 
 
 		 148 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  37.97 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  28.87 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  26.79 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  52.94 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  26.79 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 509 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  26.79 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  26.67 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  27.84 
 
 		 416 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  56.67 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  33.85 
 
 		 79 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  48.65 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  35.09 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  32 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  25 
 
 		 305 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>