85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001142 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  88.16 
 
 		 228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  59.29 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  59.47 
 
 		 208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  37.95 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  46.96 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  41.32 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  37.8 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  36.72 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  39.05 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  37.38 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  31.43 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  33.61 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  26.11 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  33.05 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  32.65 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  33.02 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  29.75 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  24.49 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  31.15 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  28.7 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  33.67 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  25.64 
 
 		 316 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  37.5 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  40 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  30.83 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  39.66 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  42.55 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.94 
 
 		 752 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  37.7 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  36.07 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  44.68 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 327 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  28.26 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  25 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  38.46 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  35.19 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  38.1 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  35.19 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  36.92 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  37.7 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  35.59 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  42.11 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  58.06 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  33.87 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  36.84 
 
 		 469 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  40.38 
 
 		 700 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  33.33 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  34.91 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  41.67 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  32.79 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  30.43 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  44.44 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 		 385 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  53.85 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1654  Ion transport 2 domain-containing protein  32 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.773346  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  24.27 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30.65 
 
 		 277 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 330 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  53.85 
 
 		 274 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  37.74 
 
 		 509 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  42.22 
 
 		 283 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 326 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  45 
 
 		 263 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  31.46 
 
 		 304 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  30.65 
 
 		 295 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  46.67 
 
 		 273 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  46.67 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  46.67 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>