32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2482 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  64.41 
 
 
231 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  38.1 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  38.1 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  31.87 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  34.51 
 
 
271 aa  75.1  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  38.6 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  40.19 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  38.71 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  34.86 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  38.89 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.74 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  33.61 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.86 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  40 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  34.21 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  29.2 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  22.73 
 
 
264 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  24.41 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  23.81 
 
 
220 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  32.17 
 
 
290 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  32.17 
 
 
311 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  32.17 
 
 
311 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  22.73 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.581577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>