50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1772 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  34.71 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.25 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  29.84 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  47.52 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  38.74 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.21 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  36.19 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  39.05 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  39.13 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  41.44 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  35.9 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  31.87 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  45.45 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  37.43 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  41.44 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  47.42 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  36.52 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  45.65 
 
 		 102 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  35.4 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  35.4 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.14 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  30.97 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  28.06 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  29.32 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  26.77 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  37.38 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  31.86 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  32.76 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  30.95 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2107  hypothetical protein  24.77 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.46407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  24.03 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  32.08 
 
 		 134 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 409 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 		 438 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  38.89 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  33 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  37.68 
 
 		 347 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  58.33 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1173  Ion transport 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 298 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  26.12 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 		 385 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 416 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>