29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1362 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  69.4 
 
 
134 aa  202  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0503  potassium channel protein  43.65 
 
 
134 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0535  potassium channel protein  43.65 
 
 
134 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0211593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0518  putative potassium channel protein  44.72 
 
 
134 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000436021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0442  LCTB protein, potassium channel  44.72 
 
 
134 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4786  putative potassium channel protein  45.22 
 
 
134 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0423111  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0540  putative potassium channel protein  45.22 
 
 
134 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0590  potassium channel protein, putative  44.35 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0446  LCTB protein, potassium channel  44.35 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0591  putative potassium channel protein  44.35 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0599184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0451  Ion transport 2 domain-containing protein  43.48 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  42.52 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
211 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  29.17 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  47.83 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  36.49 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  32.22 
 
 
234 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  47.83 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  30.19 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  31.31 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.34 
 
 
238 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  42.62 
 
 
327 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  29.89 
 
 
249 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  43.75 
 
 
326 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  34 
 
 
229 aa  40.4  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  48.84 
 
 
405 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  45.45 
 
 
222 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  28.3 
 
 
269 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>