32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31186 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  100 
 
 
700 aa  1455    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  29.33 
 
 
807 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  30.77 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  25.29 
 
 
448 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  25.47 
 
 
277 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  32.81 
 
 
128 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  20.8 
 
 
948 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  27.17 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  37.29 
 
 
79 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  40.68 
 
 
332 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  27.18 
 
 
131 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0518  Ion transport 2 domain protein  32.39 
 
 
121 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6452  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
126 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0775  Ion transport 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
397 aa  48.5  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  26.13 
 
 
344 aa  47.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  22.49 
 
 
328 aa  47.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.59 
 
 
354 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  25.15 
 
 
272 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.36 
 
 
341 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 
335 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  24.79 
 
 
241 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17765  VIC family transporter: potassium ion channel, potassium voltage-gated channel, subfamily H (Eag-related)  34.78 
 
 
735 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000050158  hitchhiker  0.00697656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  29.73 
 
 
119 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 
274 aa  45.8  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  39.66 
 
 
271 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.14 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 
335 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.73 
 
 
325 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
202 aa  43.9  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4491  Ion transport 2 domain protein  28.21 
 
 
188 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  28.1 
 
 
346 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  32.14 
 
 
326 aa  43.9  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>