80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38821 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  100 
 
 
469 aa  957    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  47.73 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  36.54 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  27.22 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  25.69 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  35.58 
 
 
131 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  39.29 
 
 
244 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  20.31 
 
 
807 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  24.32 
 
 
948 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  39.34 
 
 
135 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  34.94 
 
 
393 aa  54.3  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  36.9 
 
 
244 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  34.18 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  31.91 
 
 
281 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  35 
 
 
251 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  37.14 
 
 
335 aa  51.6  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  35.29 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  31.19 
 
 
140 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.21 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
260 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  29.35 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  29.35 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  29.67 
 
 
128 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  32.39 
 
 
132 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  50 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  50 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  37.7 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.74 
 
 
350 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  33.98 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  47.62 
 
 
335 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  32.31 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  32.31 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  28.18 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.85 
 
 
351 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  39.74 
 
 
331 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  25.77 
 
 
391 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  25.77 
 
 
391 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.29 
 
 
337 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  29.21 
 
 
279 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  25.77 
 
 
391 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  34.25 
 
 
341 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  36.21 
 
 
79 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  26.13 
 
 
255 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  20.94 
 
 
700 aa  47  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  23.19 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
252 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  40.91 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  32.5 
 
 
355 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  27.59 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.73 
 
 
355 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  27.59 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  27.59 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.84 
 
 
228 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  27.59 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  26.98 
 
 
391 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 
351 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  54.29 
 
 
398 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  34.29 
 
 
220 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  26.79 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  32.89 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  24.07 
 
 
271 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.47 
 
 
350 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  27.54 
 
 
428 aa  43.5  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  31.71 
 
 
354 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  37.68 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 
366 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
376 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  30.12 
 
 
230 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.47 
 
 
350 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 
397 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  31.07 
 
 
257 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  57.58 
 
 
345 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>