More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2531 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  45.8 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  42.11 
 
 
273 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  44.39 
 
 
248 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  37.19 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  35.06 
 
 
247 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  39.78 
 
 
247 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  38.98 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  38.42 
 
 
246 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  39.78 
 
 
247 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  38.42 
 
 
246 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  40.68 
 
 
245 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  39.09 
 
 
252 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  29.48 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  39.91 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  36.55 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  36.46 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  40.94 
 
 
247 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  37.77 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  40.11 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  35.03 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  32.81 
 
 
250 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  32.63 
 
 
250 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  33.7 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  30.94 
 
 
251 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  38.38 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  44.93 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  38.38 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.38 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.38 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.38 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  38.38 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  34.04 
 
 
146 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  47.22 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  35 
 
 
135 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  39.02 
 
 
397 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  42.11 
 
 
350 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
335 aa  59.3  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  34.74 
 
 
231 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  29 
 
 
131 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  33.66 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  37.63 
 
 
509 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  34.34 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  31.25 
 
 
128 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.61 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  32.26 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 
335 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  38.37 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 
350 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  38.24 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
335 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
346 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  60 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  34.33 
 
 
517 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  37.63 
 
 
416 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  35.96 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  40.23 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  39.24 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  35.59 
 
 
79 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  43.28 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  35.42 
 
 
531 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  34.02 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 
350 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  35.16 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  39.8 
 
 
420 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  39.8 
 
 
420 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  44.64 
 
 
338 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  37.23 
 
 
331 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  32.67 
 
 
346 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  42.19 
 
 
271 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.7 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  38.36 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  38.03 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  31.43 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  56.41 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  32.5 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  31.43 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  34.48 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  40 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  38.36 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  27.63 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  35.83 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  38.36 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  34.92 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  27.71 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>