83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3417 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 		 752 aa  1500    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  44.27 
 
 		 307 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  44.27 
 
 		 307 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.57 
 
 		 320 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  41.24 
 
 		 299 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.08 
 
 		 323 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  38.06 
 
 		 303 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  36.81 
 
 		 333 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  36.81 
 
 		 333 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  36.81 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.65 
 
 		 311 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  34.92 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.79 
 
 		 313 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  36.68 
 
 		 288 aa  191  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  36.88 
 
 		 323 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  37.87 
 
 		 304 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.69 
 
 		 319 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  36.23 
 
 		 317 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.31 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.15 
 
 		 304 aa  180  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  37.72 
 
 		 320 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.08 
 
 		 305 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  37.16 
 
 		 307 aa  177  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.75 
 
 		 326 aa  174  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.02 
 
 		 321 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.46 
 
 		 293 aa  171  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  35.99 
 
 		 322 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  35.99 
 
 		 322 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  35.99 
 
 		 322 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  30.71 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  33.44 
 
 		 403 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.94 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.32 
 
 		 305 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  28.2 
 
 		 330 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.18 
 
 		 305 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  28.52 
 
 		 299 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  28.03 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  26.1 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  27.53 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  29.43 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  26.37 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.15 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  25.61 
 
 		 399 aa  72  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  25.75 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  27.27 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  25.58 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  26.58 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  27.24 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  26.37 
 
 		 404 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  24.75 
 
 		 417 aa  63.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  25.62 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  29.5 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  26.36 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  24.83 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  26.06 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  27.17 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  23.36 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  25.26 
 
 		 415 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  23.16 
 
 		 537 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  33.6 
 
 		 684 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  25.23 
 
 		 397 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  22.91 
 
 		 396 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  28.16 
 
 		 526 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  27.18 
 
 		 294 aa  55.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  23.08 
 
 		 396 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  26.06 
 
 		 400 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  26.53 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03340  expressed protein  36.26 
 
 		 550 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  28.64 
 
 		 388 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  23.61 
 
 		 407 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  26.58 
 
 		 396 aa  50.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  23.16 
 
 		 377 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  26.87 
 
 		 398 aa  49.3  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 230 aa  48.9  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  25.25 
 
 		 396 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  24.59 
 
 		 430 aa  46.6  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  32.94 
 
 		 228 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  25 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  40.68 
 
 		 256 aa  45.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  25.81 
 
 		 389 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  24.28 
 
 		 428 aa  44.7  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 344 aa  44.3  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>