26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1163 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1163  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5619  Ion transport 2 domain-containing protein  37.25 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00971652  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  35.59 
 
 		 399 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 398 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  51.11 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  41.82 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  44.68 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  28.72 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  35.8 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  36.36 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  36.36 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  53.85 
 
 		 395 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  35.29 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  45.45 
 
 		 420 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  45.45 
 
 		 420 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  31.75 
 
 		 271 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>