16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5619 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5619  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  335  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00971652  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  33.6 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1163  Ion transport 2 domain protein  39.53 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4491  Ion transport 2 domain protein  33.08 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  50 
 
 		 258 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  48.15 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  32.08 
 
 		 438 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  46.15 
 
 		 356 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  32.08 
 
 		 408 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  28.1 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1491  Ion transport 2 domain protein  40.35 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0538744  normal  0.996419 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  28.1 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  44.44 
 
 		 258 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 395 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>