157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2720 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  87.94 
 
 		 258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  80.16 
 
 		 258 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  76.95 
 
 		 258 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  61.54 
 
 		 256 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  63.24 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  64.37 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  58.89 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  58.89 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  49.21 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  42.28 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1178  Ion transport 2  42.29 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  40.49 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2729  putative ion transport protein  42.52 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236558  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1838  Ion transport 2 domain protein  40.08 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.08 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  30.9 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  28.05 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  28.05 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  27.09 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  24.21 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  29.03 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.28 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  30.19 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  26.22 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  25.33 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  24.91 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  24.91 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  23.72 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  24.66 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  25.29 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  24.54 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  23.98 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  21.92 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  23.98 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  23.98 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  23.98 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  21.93 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  26.52 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  25.28 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  25.91 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  21.66 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  22.26 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  24.15 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  25 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  24.04 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  21.26 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  29.1 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  36.67 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  23.13 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  21.79 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  25.79 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  25.6 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  22.6 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  22.18 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  23.35 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  23.98 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  22.6 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  23.35 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  22.6 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  22.98 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  20.53 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  27.93 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  26.28 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  25.53 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  24.71 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  21.98 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  20.37 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  22.18 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  24.31 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  32.95 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  22.18 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  24.04 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  22.6 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  24.89 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  33.33 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  25 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  20.63 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  29.13 
 
 		 430 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25.33 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.06 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  37.63 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  28.35 
 
 		 405 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  22.64 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  22.64 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  22.64 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  22.64 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  22.64 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  36.05 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  32.18 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  27.56 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  27.56 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  36.51 
 
 		 509 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>