254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1582 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  40.52 
 
 
263 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  40.28 
 
 
276 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  36.19 
 
 
282 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  36.36 
 
 
271 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  36.3 
 
 
269 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  31.75 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  32.35 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  32.97 
 
 
277 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.73 
 
 
282 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  32.6 
 
 
276 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  31.37 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  29.21 
 
 
282 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  29.86 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  30.89 
 
 
295 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  33.33 
 
 
290 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  33.45 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  34.96 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30.71 
 
 
287 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  31.82 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.3 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  32.1 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  32.1 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  32.1 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  32.1 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  30.32 
 
 
289 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.67 
 
 
277 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  29.3 
 
 
276 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  30.47 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  29.75 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  30.8 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  31.06 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  31.65 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  27.64 
 
 
273 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.17 
 
 
272 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  31.29 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  31.29 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  31.29 
 
 
278 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  27.44 
 
 
284 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  32.68 
 
 
230 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  27.74 
 
 
303 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  31.29 
 
 
278 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  29.06 
 
 
283 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  29.86 
 
 
273 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  27.68 
 
 
273 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  30.18 
 
 
272 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  25.51 
 
 
292 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  25.86 
 
 
298 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.09 
 
 
273 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.12 
 
 
283 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  26.47 
 
 
271 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  26.84 
 
 
279 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  26.43 
 
 
276 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  27.46 
 
 
305 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  27.94 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  29.18 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.36 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  26.3 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  31.14 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  24.32 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.34 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  26.32 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  29.83 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  27.47 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  30.3 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  27.31 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  25.35 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  29.92 
 
 
297 aa  92  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  29.08 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.36 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.97 
 
 
408 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  28.9 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  27.53 
 
 
277 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  25.34 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  30.68 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  29.73 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  28.86 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  28.88 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  28.11 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.75 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  28.47 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29.17 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.1 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  24 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  27.09 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  27.69 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  29.34 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  25.77 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  25.77 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  23.33 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  23.51 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  33.61 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  34.58 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.62 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  28.1 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  25 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 
531 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  29.82 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  26.17 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  26.61 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>