16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1861 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  34.64 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  28.75 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  32.63 
 
 		 362 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  38.96 
 
 		 298 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  29.56 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  41.56 
 
 		 418 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 		 368 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  42.35 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  35.06 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  39.19 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  34.23 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 		 361 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>