141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5570 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5570  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  70.4 
 
 
281 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  59.68 
 
 
279 aa  251  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  51.26 
 
 
140 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3379  Ion transport 2  47.57 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0913858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  26.46 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  32.8 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  27.88 
 
 
328 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  32.06 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  34.58 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  28.06 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  26.77 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.97 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  32.32 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  35.21 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  33.33 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  31.25 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  27.87 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  26.51 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  35.45 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  28.57 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  29.36 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  31.93 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  34.48 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  32.05 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.71 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  23.89 
 
 
277 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  27.01 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  27.01 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  27.01 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  27.01 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  27.35 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  25.74 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  27.68 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  25.59 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  31.11 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  23.3 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.25 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  25.59 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  20.65 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  32.89 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  23.66 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  32.98 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  32.98 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  32.98 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  32.98 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  32.98 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  35.79 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  34.25 
 
 
334 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.25 
 
 
334 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  26.76 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  22.08 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.25 
 
 
330 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  29.41 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  22.76 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  42.31 
 
 
428 aa  48.9  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  28.74 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.88 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  23.89 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  22.73 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  28.16 
 
 
517 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.88 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  34.48 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  29.47 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  26.02 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  27.12 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  23.94 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  23.94 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.6 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  43.94 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  29.17 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  27.59 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  23.94 
 
 
274 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  32.91 
 
 
279 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  26.28 
 
 
269 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  23.94 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  22.22 
 
 
531 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  32.58 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  35.14 
 
 
260 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  31.75 
 
 
79 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
330 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  35.56 
 
 
331 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  26.79 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  22.28 
 
 
405 aa  46.2  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  30.77 
 
 
391 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.38 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  30.77 
 
 
391 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  30.77 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  38.6 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  38.6 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  26.12 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  32.58 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  31.4 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  29.13 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  25.89 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>