212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17521 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  100 
 
 		 333 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 		 360 aa  319  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  44.71 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  40.86 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  32.04 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  28.44 
 
 		 385 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  25.15 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  20.92 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  32.52 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  37.36 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  40 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  36.19 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  36.14 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  36.46 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  31.9 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  43.75 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  30.09 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  31.96 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.9 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 270 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  45.31 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  34.29 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.14 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  30.21 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  32.69 
 
 		 517 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  41.27 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.65 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  32.04 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.76 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  34.34 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.32 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.79 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  44.07 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  30.08 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  46.3 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  35.14 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.67 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  41.89 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  28.36 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  29.27 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.19 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  31.96 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  43.1 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  39.66 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  29.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  38.24 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.17 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  47.06 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.12 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  32.93 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.35 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  27.42 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 		 494 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>