More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5634 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
376 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  53.13 
 
 
375 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  40.68 
 
 
385 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  32.04 
 
 
386 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
354 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  28.28 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
367 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
360 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  25 
 
 
357 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  24.6 
 
 
333 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
352 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 
363 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
345 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  37.86 
 
 
247 aa  86.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.07 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.88 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  32.86 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  41.89 
 
 
502 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  41.89 
 
 
502 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
247 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
249 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
251 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.85 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.85 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.85 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
253 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
247 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.54 
 
 
247 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 
250 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
265 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  31.41 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.52 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6340  extracellular solute-binding protein family 3  43.84 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646193  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
233 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  36.59 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.47 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
252 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.65 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.62 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  33.6 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  36.59 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.62 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.65 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.65 
 
 
265 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.65 
 
 
265 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.79 
 
 
248 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.5 
 
 
248 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  36.78 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.23 
 
 
266 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 
248 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  37.21 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
266 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
266 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 
257 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.21 
 
 
266 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
265 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>