More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3185 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 386 aa  770    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  33.23 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  32.33 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  30.7 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 352 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  29.48 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  28.28 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.41 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  39.69 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.2 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.77 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.21 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.08 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.21 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  40.22 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.26 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.03 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.82 
 
 		 248 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.82 
 
 		 248 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.58 
 
 		 247 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 247 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.58 
 
 		 248 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.03 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  31.82 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.8 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  25.24 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.09 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  35.45 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  34.69 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.04 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  33.04 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  33.04 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  34.65 
 
 		 256 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.77 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.45 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.72 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  38.14 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  34.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  34.31 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  35.42 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.95 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  34.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.93 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>