More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1231 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 366 aa  755    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  59.28 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  26.02 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  28.07 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  26.61 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  24.56 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  24.5 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  39.08 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  32.19 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34.94 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 244 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.37 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  34.78 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  35.23 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  33.65 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.73 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.73 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.73 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 239 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.73 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.12 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.78 
 
 		 268 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.38 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  33.33 
 
 		 501 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.56 
 
 		 480 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.31 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 261 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.59 
 
 		 252 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  31.01 
 
 		 257 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0945  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.99 
 
 		 177 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.656461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.55 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  31.43 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.24 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.24 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>