297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4522 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
375 aa  758    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  54.25 
 
 
376 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  40.05 
 
 
385 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
354 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
386 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
378 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  25.75 
 
 
333 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  26.25 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  24.78 
 
 
357 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
382 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  24.41 
 
 
345 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.46 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  40.29 
 
 
247 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.59 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  33.81 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.28 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.81 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.81 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.81 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.04 
 
 
248 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
249 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.29 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.62 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.57 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.86 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
264 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
250 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
268 aa  67  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.71 
 
 
252 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
247 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.97 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.49 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.49 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  33.1 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.34 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  29.61 
 
 
284 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
494 aa  56.6  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.17 
 
 
263 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  38.03 
 
 
259 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.03 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
252 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  28.17 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  26.32 
 
 
262 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
265 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.03 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 
278 aa  53.5  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  26.12 
 
 
269 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  31.69 
 
 
254 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  25.53 
 
 
271 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.87 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  25.53 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 
282 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.45 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.45 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 
239 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.45 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.14 
 
 
264 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>