More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0534 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 378 aa  773    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  64.74 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  54.73 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  35.74 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  30.12 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  32.05 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  29.21 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  29 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  37.01 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  40.4 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.81 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  40.7 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  34.71 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.17 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  41.89 
 
 		 241 aa  72  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.5 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  35.43 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  41.46 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.2 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.83 
 
 		 247 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  35.23 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  35.23 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  35.23 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  35.56 
 
 		 736 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  36.78 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.52 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  37.5 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  37.5 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0384  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  44.3 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  34.09 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.66 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  35.56 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.04 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  33.67 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  43.04 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.74 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.58 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  32.08 
 
 		 517 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  28.87 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  38.16 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.59 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  34.09 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>