More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0384 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0384  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 290 aa  597  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.24 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  29.71 
 
 		 572 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  30.13 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.86 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.86 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.86 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.19 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.54 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  28.17 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.15 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.65 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.63 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.53 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.53 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  31.72 
 
 		 252 aa  99  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.8 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.8 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.8 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.2 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.6 
 
 		 481 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 493 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.45 
 
 		 503 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  30.64 
 
 		 714 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  31.5 
 
 		 480 aa  95.9  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.01 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  29.31 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  29.33 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  30 
 
 		 608 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 620 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  28.5 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.19 
 
 		 489 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  28.89 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.19 
 
 		 489 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  28.19 
 
 		 489 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27 
 
 		 503 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.63 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 604 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 590 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.8 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 609 aa  92  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.07 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.2 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.49 
 
 		 502 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.49 
 
 		 502 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  26.56 
 
 		 501 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  26.91 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>