167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1169 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.51 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.97 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  30.54 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  30.96 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  43.37 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.38 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  34.69 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.91 
 
 
408 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  33.64 
 
 
419 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  28.45 
 
 
409 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  38.78 
 
 
331 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  42.11 
 
 
367 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  37.89 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28.92 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  24.27 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  25.82 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  25.91 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  26.72 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  39.29 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  23.63 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  27.87 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  33.98 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.04 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  30.52 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  39.47 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.38 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  25.61 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  29.15 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
360 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
352 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.91 
 
 
517 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  30.57 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  40 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  30.3 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.01 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.39 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  28.77 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  25.61 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  36.49 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  35.29 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.72 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  36.63 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  38.82 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  38.55 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.16 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  38.55 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  34.92 
 
 
405 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  38.55 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  40.32 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.83 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
344 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.77 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  29.01 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  38.75 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  30.09 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.77 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.77 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.77 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  29.01 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  44.26 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  42.62 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.39 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  36.92 
 
 
513 aa  52  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  27.43 
 
 
357 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  30.19 
 
 
428 aa  51.2  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28.64 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  23.72 
 
 
299 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  26.05 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  23.19 
 
 
308 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  32.93 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  29.01 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  28.09 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  40.7 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.03 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  34.78 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  38.24 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  26.59 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  28.26 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  36.47 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  29.59 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  34.94 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  39.76 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  30.71 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  34.72 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  29.6 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  33.98 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 
509 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  28.8 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  37.68 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  37.68 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  35.96 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  24.14 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  23.61 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  35.71 
 
 
430 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  29.58 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 
396 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  36.14 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  48 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>