More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2700 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  99.53 
 
 
215 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  95.35 
 
 
215 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
219 aa  112  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
225 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
415 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.74 
 
 
224 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 
225 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
225 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.37 
 
 
253 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.68 
 
 
225 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.28 
 
 
224 aa  101  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.12 
 
 
226 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 
228 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.77 
 
 
226 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.55 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.66 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.57 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
226 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.14 
 
 
225 aa  94  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.85 
 
 
228 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.89 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.78 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.58 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
224 aa  89  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.22 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
242 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.73 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.77 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5645  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.71 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.39 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  25.39 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.39 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  25.39 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  25.39 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.39 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.39 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.39 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.73 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
223 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.88 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  32.64 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  33.63 
 
 
407 aa  79  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.27 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.26 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.38 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.12 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.09 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  32.94 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  25.41 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  25.95 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>