More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1605 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  52.22 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.35 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.5 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  45.33 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  46.27 
 
 		 685 aa  70.1  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.43 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  43.28 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  38.36 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  40.54 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 		 387 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.71 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  37.8 
 
 		 377 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  41.18 
 
 		 390 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  34.52 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35 
 
 		 456 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.74 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  32.73 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.71 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.63 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  33.7 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.24 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  36.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  28.81 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 444 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 444 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 284 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.18 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.24 
 
 		 478 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.1 
 
 		 392 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.66 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.06 
 
 		 383 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 484 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 478 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 478 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 484 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  36.76 
 
 		 478 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 470 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 288 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1054  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.72 
 
 		 564 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000017459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.88 
 
 		 392 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.33 
 
 		 478 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 470 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.51 
 
 		 397 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>