More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2515 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
139 aa  289  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.43 
 
 
254 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  40.5 
 
 
251 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  39.09 
 
 
151 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  34.62 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  32.73 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  31.25 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  29.11 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  30.3 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  35.79 
 
 
685 aa  60.8  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.8 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  30.5 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  30.7 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  32.37 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.56 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  27.85 
 
 
269 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.61 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  27.4 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.96 
 
 
378 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  27.63 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.09 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30.63 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  27.05 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  23.01 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  31.03 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.01 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  27.56 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.19 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  27.68 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  33.05 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  29.25 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  25.38 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  27.66 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.05 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  28.97 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
116 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  31.9 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  32.65 
 
 
390 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3197  rhodanese-like protein  29.82 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  30.77 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 
471 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.15 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
390 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 
147 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  27.96 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  32.32 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
469 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  29.79 
 
 
229 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  28.18 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  25.18 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  30 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  26.15 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  25.9 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.18 
 
 
387 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  31.68 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  33.71 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  25.89 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  29.79 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  29.46 
 
 
711 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  30.11 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  26.24 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>