57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0702 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  230  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  50.46 
 
 
124 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  46.94 
 
 
105 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1412  hypothetical protein  42.99 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.443003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0626  hypothetical protein  44.9 
 
 
105 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  45.05 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  39.53 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  36.9 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  27.03 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  29.25 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.55 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  26.72 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  27.47 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.94 
 
 
550 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.59 
 
 
251 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  32.22 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  28.87 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.04 
 
 
478 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
356 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  30 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  27.37 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  26.47 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0780  rhodanese domain-containing protein  23.66 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.112392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  33.65 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  33.65 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.9 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
277 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 
135 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  34.57 
 
 
379 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  32.53 
 
 
116 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  21.9 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  28.12 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
403 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  25.26 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  26.04 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  35.56 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.8 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 
277 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  27.27 
 
 
108 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
116 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  32.56 
 
 
391 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  29.07 
 
 
280 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>