More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1899 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.86 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.07 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  37.78 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  37.78 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.89 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  35.16 
 
 		 442 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 354 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 354 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 354 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 		 469 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  29.51 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.87 
 
 		 456 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  37.37 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.16 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 472 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  32.89 
 
 		 565 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.68 
 
 		 453 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.71 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 		 548 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  25.81 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.63 
 
 		 548 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0058857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2756  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.63 
 
 		 548 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394023  normal  0.393296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  28.42 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  29.36 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1398  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.41 
 
 		 554 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00125379  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 470 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  30.77 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 298 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.89 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  34.72 
 
 		 391 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.9 
 
 		 457 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  30.12 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  29.35 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 444 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 467 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 463 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 444 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  36.23 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 		 581 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  33 
 
 		 356 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.84 
 
 		 817 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 466 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  34.72 
 
 		 381 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.56 
 
 		 560 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.98 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.98 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.91 
 
 		 817 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 484 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  42.65 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.5 
 
 		 400 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32.98 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  30.48 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.42 
 
 		 480 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  29.52 
 
 		 390 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.52 
 
 		 813 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>