119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1513 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1225  Rhodanese domain protein  54.45 
 
 
284 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  25.53 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  25.58 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 
124 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  33.96 
 
 
97 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  28.05 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  25.96 
 
 
220 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
444 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
444 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.36 
 
 
124 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.36 
 
 
124 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
466 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  27.45 
 
 
116 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
127 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
388 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  40 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  28.57 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.46 
 
 
106 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
197 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
480 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
146 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.7 
 
 
142 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 
549 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
581 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
129 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  23.53 
 
 
247 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
135 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  31.52 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.1 
 
 
390 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 
113 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 
116 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 
389 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.36 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 
129 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
817 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
117 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  22.96 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
470 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.2 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  26.73 
 
 
252 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  23.93 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  24.55 
 
 
216 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
138 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  23.96 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.05 
 
 
123 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  31.37 
 
 
129 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
153 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.05 
 
 
163 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  35.96 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.13 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  29.25 
 
 
140 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 
116 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  29 
 
 
116 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.12 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  32.43 
 
 
115 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  29.21 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  26.53 
 
 
459 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
122 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  20.96 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  27.54 
 
 
150 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
126 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.91 
 
 
938 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.86 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  24.74 
 
 
109 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.18 
 
 
568 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
113 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
103 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48801  predicted protein  29.55 
 
 
118 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
484 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.91 
 
 
126 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1604  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.82 
 
 
197 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.43 
 
 
454 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  32.93 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  29.89 
 
 
150 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
138 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
148 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
119 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  30.38 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.98 
 
 
478 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.59 
 
 
568 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.12 
 
 
456 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  30.15 
 
 
171 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>