84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1225 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1225  Rhodanese domain protein  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  54.45 
 
 
298 aa  329  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.67 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.67 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.52 
 
 
568 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.52 
 
 
142 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  24.87 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.7 
 
 
398 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.11 
 
 
390 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  32.29 
 
 
345 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.96 
 
 
393 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.76 
 
 
386 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 
388 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.61 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.76 
 
 
141 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.45 
 
 
566 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  28.29 
 
 
141 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  21.77 
 
 
567 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  30.69 
 
 
229 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.52 
 
 
392 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  34.38 
 
 
154 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  24.16 
 
 
144 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  25.79 
 
 
145 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 
479 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
820 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
112 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0073  hypothetical protein  28.09 
 
 
101 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 
135 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 
480 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  27.11 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  33.33 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.61 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  26.14 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A35  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 
547 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.634534  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2657  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
123 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.85 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  34.12 
 
 
566 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  27.88 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  29 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  22.45 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  28.09 
 
 
136 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  24.53 
 
 
144 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.96 
 
 
567 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  30.25 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.14 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  26.88 
 
 
151 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
140 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.21 
 
 
189 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  26.09 
 
 
396 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  24.39 
 
 
124 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  24.39 
 
 
124 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  26.15 
 
 
125 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
127 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  25.74 
 
 
123 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1676  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.4 
 
 
555 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  23.65 
 
 
567 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.27 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 
525 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  28.89 
 
 
97 aa  42.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.47 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  26.98 
 
 
155 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2650  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 
123 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.846466  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  28.92 
 
 
109 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.33 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
143 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
123 aa  42.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
132 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  30.56 
 
 
129 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  26.21 
 
 
321 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  26.74 
 
 
549 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.38 
 
 
106 aa  42.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
117 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  26.74 
 
 
549 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.76 
 
 
386 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 
114 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>