More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0580 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  46.76 
 
 
135 aa  130  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
136 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.72 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1046  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.23 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  41.46 
 
 
685 aa  67  0.00000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  36.78 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.97 
 
 
229 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  38.2 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
339 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  39.77 
 
 
341 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
331 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  35.92 
 
 
333 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  36.36 
 
 
336 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  34.95 
 
 
330 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  34.95 
 
 
333 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  34.95 
 
 
330 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  42 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  32.05 
 
 
201 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.35 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  39.02 
 
 
254 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  32.58 
 
 
352 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  38.55 
 
 
350 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  28 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  34.95 
 
 
334 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  35.56 
 
 
326 aa  53.9  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  33.98 
 
 
334 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  36.23 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  33.98 
 
 
334 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  33.98 
 
 
334 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  33.98 
 
 
334 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  36.67 
 
 
326 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  38.57 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  32.58 
 
 
352 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  38.2 
 
 
368 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  34.44 
 
 
337 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 
388 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  38.2 
 
 
368 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  35.23 
 
 
323 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
302 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  39.02 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  36.62 
 
 
132 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  37.35 
 
 
323 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 
332 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
346 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
326 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.54 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.88 
 
 
389 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  34.09 
 
 
355 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  34.09 
 
 
339 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  34.94 
 
 
326 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  34.09 
 
 
355 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  36.22 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
306 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  38.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  38.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  38.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  38.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
222 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 
304 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  31.63 
 
 
567 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
321 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  31.46 
 
 
332 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  30.1 
 
 
324 aa  50.1  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  32.53 
 
 
312 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  32.95 
 
 
356 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 
327 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3629  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.06 
 
 
557 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  30.68 
 
 
355 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>