136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1537 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3197  rhodanese-like protein  49.32 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  34.72 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  34.72 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.09 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.5 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  32.1 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  27.35 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 244 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 130 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  34.12 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  36.04 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.01 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 113 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  28.43 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  39.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.11 
 
 		 387 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  31.33 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  40.85 
 
 		 116 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 488 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  48.1  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 480 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 		 549 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.51 
 
 		 390 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.32 
 
 		 361 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2484  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  23.15 
 
 		 254 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 108 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  31.9 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  38.27 
 
 		 457 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.73 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 381 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  27.45 
 
 		 339 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  29.17 
 
 		 118 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  34.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 464 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  27.04 
 
 		 312 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  28.08 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  23.15 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.24 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  26.88 
 
 		 312 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 470 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.97 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.21 
 
 		 320 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  31.33 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 462 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  35.94 
 
 		 502 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  24.24 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  24.42 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 459 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  30.86 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  32.47 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.62 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.59 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  25.68 
 
 		 271 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  34.69 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  22.73 
 
 		 381 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 284 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  24.55 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  23.75 
 
 		 304 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.65 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  47.54 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  26.42 
 
 		 305 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  31.33 
 
 		 313 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30 
 
 		 127 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30 
 
 		 170 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 		 116 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.71 
 
 		 568 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  23.75 
 
 		 302 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>