58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3771 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3197  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.78 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.28 
 
 		 392 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35.9 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.18 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  29.63 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  22.58 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  28 
 
 		 124 aa  44.3  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  38.36 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  31.63 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  23.84 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31.65 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  29.31 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.32 
 
 		 229 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31 
 
 		 170 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.87 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 489 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.21 
 
 		 392 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.21 
 
 		 386 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  28.7 
 
 		 209 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  35.78 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  35.78 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  30.12 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  31.73 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.09 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  27.52 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 122 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.22 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  33.72 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.57 
 
 		 560 aa  40.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.71 
 
 		 392 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>