62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3197 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3197  rhodanese-like protein  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  54.95 
 
 
175 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.63 
 
 
251 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  27.15 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
470 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.09 
 
 
361 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 
140 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  30.38 
 
 
135 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.41 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
141 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  34.75 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.5 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
488 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  25.93 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  28.17 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  28.17 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  27.07 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  29.46 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  30 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  27.96 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  27.35 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  23.21 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  33.05 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.91 
 
 
383 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.2 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  25.66 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
113 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2484  Rhodanese domain protein  26.98 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  26.88 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  26.88 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  26.88 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 
392 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 
190 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  33.78 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  24.77 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 
103 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  26.8 
 
 
129 aa  40.4  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.46 
 
 
393 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
464 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  21.24 
 
 
106 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>