More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2484 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2484  Rhodanese domain protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  44.86 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.23 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.11 
 
 
386 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.96 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.78 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  30.7 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.74 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.67 
 
 
189 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.76 
 
 
484 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
269 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.76 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.76 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  41.77 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.76 
 
 
484 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  41.76 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  42.22 
 
 
459 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
472 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.89 
 
 
455 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
480 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.73 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.93 
 
 
386 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.46 
 
 
393 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.58 
 
 
392 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.33 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  39.78 
 
 
389 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  43.37 
 
 
479 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.74 
 
 
395 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  41.89 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.42 
 
 
393 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.96 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.65 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
361 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 
140 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 
386 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.05 
 
 
390 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
480 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  43.02 
 
 
376 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
376 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
220 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
369 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  29.73 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  38.03 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  39.29 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.78 
 
 
478 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.24 
 
 
392 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
379 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.18 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  39.19 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  34.44 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  39.19 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.19 
 
 
186 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  38.04 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  40.7 
 
 
378 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
271 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
257 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.25 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36.71 
 
 
186 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  38.78 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
466 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  50 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>