More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1502 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  229  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  89.29 
 
 
113 aa  209  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  55.29 
 
 
145 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  55.29 
 
 
269 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  43 
 
 
484 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  43 
 
 
478 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  43 
 
 
478 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  43 
 
 
478 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  43 
 
 
484 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  42 
 
 
478 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  50 
 
 
132 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
478 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 
220 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  49.46 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  42 
 
 
471 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.27 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.61 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 
129 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  47 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  37.25 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.41 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  45.13 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.35 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  39.6 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.87 
 
 
395 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.74 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.68 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  44.05 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.16 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  44.05 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  45.24 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  35.4 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  41.76 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  41.76 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.17 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  41.76 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.09 
 
 
562 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 
480 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
103 aa  77  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.74 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  39.56 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.59 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.14 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.58 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  45.24 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 
476 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 
472 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.05 
 
 
561 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.53 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.39 
 
 
392 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  46.24 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  39.08 
 
 
479 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  45.78 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 
392 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.22 
 
 
383 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.59 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  38.46 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.03 
 
 
189 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.45 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  39.25 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>