215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1790 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  100 
 
 
151 aa  312  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  44.03 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.77 
 
 
254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.65 
 
 
251 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  35.85 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  35.87 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  33.59 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  31.01 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  30.43 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
131 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  34.95 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.41 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  27.43 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  34.15 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.36 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  29.82 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  31.63 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  25.19 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  30.83 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.04 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
354 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
354 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.03 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  33.68 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
277 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  31 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  30.59 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  46.81 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.33 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  39.68 
 
 
106 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
131 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  27.66 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  36.26 
 
 
100 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  26.26 
 
 
121 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.48 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  30.28 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  28.7 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.03 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  23.66 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  26.88 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  27.5 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  32.63 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.82 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.37 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  27.88 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
269 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
478 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  25.3 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  25.19 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  43.48 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  31.18 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  42.55 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 
284 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  25.95 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
476 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  27.73 
 
 
279 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  31.31 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>