91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6117 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  96.95 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  71.17 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  43.69 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  35.51 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  29.69 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  33.33 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.26 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  32.53 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  27.55 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  33.75 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  35.96 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0626  hypothetical protein  34.83 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  37.11 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  37.7 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1412  hypothetical protein  32.58 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.443003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  28.87 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 476 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 753 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  26.27 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 464 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  28.05 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  35.8 
 
 		 711 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 		 478 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  35.8 
 
 		 711 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.98 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 462 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 		 361 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.79 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.63 
 
 		 478 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.46 
 
 		 703 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.07 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  32.46 
 
 		 703 aa  42  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 130 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 115 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  27.96 
 
 		 136 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  27.83 
 
 		 135 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  38.03 
 
 		 147 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.66 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  27.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  31.67 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  43.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  31.52 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 488 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  32.31 
 
 		 472 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  32.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  28.7 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  32.63 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  32.63 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  33.85 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  27.64 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.25 
 
 		 280 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>