286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2421 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  71.3 
 
 
131 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  71.3 
 
 
131 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  43.09 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  33.08 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  40.17 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  33.88 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  36.08 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  38.78 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  39.06 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0626  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  28.72 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  34.94 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  31.91 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.83 
 
 
254 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1412  hypothetical protein  34.83 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.443003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
220 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.05 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  26.24 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 
271 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40.26 
 
 
711 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  40.26 
 
 
711 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.3 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.44 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  31 
 
 
201 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  34.4 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
476 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.82 
 
 
390 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  21.67 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  31.25 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.96 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  41.98 
 
 
753 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
284 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.31 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  27.08 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  27.08 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  35.71 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  33.72 
 
 
565 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.78 
 
 
386 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.21 
 
 
393 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  37.5 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 
462 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  35.8 
 
 
194 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
280 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.93 
 
 
390 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.71 
 
 
357 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.71 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  33.85 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  28.92 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.61 
 
 
251 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 
464 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.82 
 
 
110 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 
134 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 
361 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  30.63 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.39 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  30.47 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
356 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
356 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.16 
 
 
288 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
290 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>