71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0470 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  37.8 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  30.93 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  31.96 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  29.55 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  34.15 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.72 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  33.75 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  30.59 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  25.26 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 
102 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.56 
 
 
280 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  30.12 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A35  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
547 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.634534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  26.88 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3727  NADH dehydrogenase  27.47 
 
 
550 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490783  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  25.49 
 
 
198 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  32.98 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  32.56 
 
 
771 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  32.63 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  29.07 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35 
 
 
392 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  29.49 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
617 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.67 
 
 
569 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  34.52 
 
 
778 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.63 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.72 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  28.4 
 
 
390 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.43 
 
 
355 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
471 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  24.73 
 
 
145 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
569 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  31.13 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  26.88 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.4 
 
 
390 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  26.32 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  32.63 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  27.78 
 
 
685 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  30.12 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  30.12 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  24.73 
 
 
269 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  26.97 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.75 
 
 
395 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.63 
 
 
387 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  28.26 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  27.71 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  25.81 
 
 
151 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>