47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1498 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  276  9e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  32.26 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  36.79 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  36.11 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  37.82 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  33.08 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  42.86 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  35.04 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  31.03 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0626  hypothetical protein  39.53 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  39.53 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1412  hypothetical protein  37.78 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.443003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  37.35 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  36.9 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  27.96 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  26.88 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  31.71 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  26.67 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
469 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4047  hypothetical protein  30.61 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.402689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  27.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3771  hypothetical protein  30.61 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  25.78 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  31.25 
 
 
685 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25.19 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  25.19 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1046  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 
106 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  27.96 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.04 
 
 
478 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  27.84 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  28.33 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  26.27 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  28.26 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  26.21 
 
 
103 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
478 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  33.33 
 
 
116 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  21.74 
 
 
116 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>