More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0701 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  46.09 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  50.46 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0547  hypothetical protein  41 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0626  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.36 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1412  hypothetical protein  38.3 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.443003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  32.76 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.33 
 
 		 251 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.89 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.87 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.77 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  43.02 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.43 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  35.87 
 
 		 685 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 470 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 357 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  37.5 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0155  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.83 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.7 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  39.53 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  42.5 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  31.07 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.46 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.76 
 
 		 484 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.76 
 
 		 478 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.76 
 
 		 478 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  39.76 
 
 		 484 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  40.74 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  35.37 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 478 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  32.26 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  39.76 
 
 		 478 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  38.55 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.76 
 
 		 478 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.94 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  30.59 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  32.94 
 
 		 423 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  32.56 
 
 		 409 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  37.04 
 
 		 379 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  36.9 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  33.72 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.55 
 
 		 711 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  30.11 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  35.8 
 
 		 391 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  30.49 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>