More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2549 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  219  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  219  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  46.39 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  45.16 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  49.37 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  42.55 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  45.98 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  44.16 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  46.75 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  38.3 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  33.66 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.97 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  33.03 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.65 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.68 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.98 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 		 568 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.15 
 
 		 550 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.96 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  38.3 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  34.41 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.17 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.23 
 
 		 566 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.23 
 
 		 566 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.3 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.23 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.91 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.91 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40.91 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.47 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.77 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.71 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.51 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.26 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  42.17 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>