More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01624 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.89 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.09 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.33 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.19 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.19 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 189 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.89 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  35.07 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  37.38 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  46.38 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.68 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.87 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  39.02 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  34.83 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  46.48 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 		 470 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  41.43 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  31.01 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.27 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.05 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  45.07 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  45.07 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  38.68 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.05 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  30.89 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  37.63 
 
 		 247 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.84 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 361 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  31.68 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  26.72 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.65 
 
 		 390 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>