183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2496 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
154 aa  321  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  44.35 
 
 
156 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  47.58 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  39.82 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  51.52 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  49 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20970  Rhodanese-like protein  43.27 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00660232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  37.62 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  34.55 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2059  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  34.83 
 
 
209 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  33.66 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.08 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  33.62 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  32.74 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  31.82 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.07 
 
 
251 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  26.47 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  26.47 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.57 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  29.81 
 
 
271 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  36.56 
 
 
254 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  32.48 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3477  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  30.23 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  30.63 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  30.48 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  32.38 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  32.98 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  28.33 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  31.19 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.15 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  34.51 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.3 
 
 
229 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  29.73 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  31.3 
 
 
201 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  32 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
130 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  32.29 
 
 
130 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  32.35 
 
 
123 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  27.5 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0046  hypothetical protein  29.57 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0363371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>