More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0137 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  82.41 
 
 
108 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  63.55 
 
 
108 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  52.34 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  55.88 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  51.96 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  54.9 
 
 
109 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  53.47 
 
 
110 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
116 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50 
 
 
116 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  49.51 
 
 
117 aa  105  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  52.34 
 
 
107 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
116 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  50 
 
 
110 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  49.5 
 
 
107 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  54.72 
 
 
118 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  47.62 
 
 
113 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 
110 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 
112 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  50.51 
 
 
115 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 
111 aa  95.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  52.69 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 
111 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  44.34 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  53.26 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  52.81 
 
 
116 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 
110 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  46.51 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  45.24 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  38.55 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  50.62 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  48.28 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.78 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.78 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  46.25 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  46.34 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  45.56 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  45 
 
 
377 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  45.98 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  48.05 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  47.95 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  48 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 
114 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 
277 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  48.1 
 
 
472 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.3 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.53 
 
 
392 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  45.95 
 
 
189 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  41.33 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  43.02 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.45 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  44.16 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  32.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.75 
 
 
377 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  43.02 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  43.24 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  44.59 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.11 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  43.84 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  43.84 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  39.77 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  43.84 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  45.57 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  43.84 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
103 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  43.24 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
476 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.5 
 
 
563 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  39.77 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  42.47 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>