More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1915 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  100 
 
 
116 aa  223  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  52.22 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 
116 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  46.27 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  47.89 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  50 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  46.48 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  45.07 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.74 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  38.82 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  44.59 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  45.33 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  44.29 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  44.62 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  27.03 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.9 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
685 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  35.16 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  43.64 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  36.05 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  44.59 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  39.68 
 
 
229 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  44.62 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  42.19 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.29 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  47.76 
 
 
290 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  43.06 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 
284 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  42.86 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
128 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
581 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  36.76 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
479 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  27.45 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
361 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  40.58 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 
222 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
476 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
383 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35.38 
 
 
136 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.21 
 
 
456 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 
220 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
467 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  34.92 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  43.08 
 
 
288 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  28.26 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  41.18 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  41.54 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.54 
 
 
383 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.5 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
469 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 
244 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  39.02 
 
 
376 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  40 
 
 
277 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.53 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
837 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>