More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3631 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  100 
 
 		 353 aa  723    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  33.89 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.65 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  28.12 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.27 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  28.75 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  25.82 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  32.1 
 
 		 598 aa  66.2  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  30.34 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  27.66 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.62 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.5 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  31.62 
 
 		 223 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.89 
 
 		 127 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.96 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  32.86 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 164 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 112 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 125 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.25 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.25 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  31.63 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  26.96 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  34.94 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 112 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  39.47 
 
 		 132 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 138 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  30.56 
 
 		 116 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 221 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 132 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.33 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  38.03 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 103 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  29.81 
 
 		 119 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  28.85 
 
 		 119 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.56 
 
 		 116 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 218 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.44 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  34.15 
 
 		 105 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.31 
 
 		 938 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1676  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.24 
 
 		 555 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  41.94 
 
 		 118 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  34.72 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 470 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30.26 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 127 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.18 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 		 133 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 131 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 119 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 119 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>