197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0678 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  100 
 
 		 401 aa  823    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  40.8 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  37.39 
 
 		 178 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  34.33 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 123 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  35.51 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  32.19 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  31 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  31.91 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 		 130 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 128 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 172 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.96 
 
 		 129 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 		 162 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 130 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 117 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.19 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 110 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 127 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.48 
 
 		 148 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 144 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.2 
 
 		 136 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  30.25 
 
 		 120 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.58 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  32.73 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 119 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.96 
 
 		 142 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 		 126 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  30.25 
 
 		 186 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.89 
 
 		 126 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  30.25 
 
 		 186 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 126 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 112 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 		 154 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 104 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 109 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 161 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 132 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  35.29 
 
 		 129 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  25.26 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  24.8 
 
 		 186 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  29.86 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 125 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 112 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  25.24 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 222 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  37.78 
 
 		 132 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.29 
 
 		 173 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  29.9 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 125 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.09 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 		 143 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.68 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.43 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  30.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 252 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 152 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 144 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 119 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  27.73 
 
 		 186 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 158 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 155 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 209 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  32.04 
 
 		 179 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 141 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 138 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  33.73 
 
 		 136 aa  46.6  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 108 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  27.73 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  32.95 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>