296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2335 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 432 aa  887    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  43.52 
 
 		 363 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  40.31 
 
 		 377 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  30.73 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  29.83 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.04 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.71 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.28 
 
 		 247 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 252 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  25.52 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  25.37 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  25 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  24.52 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  24.25 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  25.07 
 
 		 545 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  23.4 
 
 		 528 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  25.75 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  26.33 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  26.05 
 
 		 528 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  43.16 
 
 		 172 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  26.91 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  26.91 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  27.81 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  23.95 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  23.72 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 252 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 104 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  26.64 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  26.01 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  24.68 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  22.52 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  24.06 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  23.95 
 
 		 774 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  23.56 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 112 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  24.23 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.04 
 
 		 112 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 233 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 230 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.3 
 
 		 283 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  47.27 
 
 		 189 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 114 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  22.05 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  23.85 
 
 		 216 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  27.43 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 118 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  21.62 
 
 		 470 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  21.45 
 
 		 526 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 124 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 147 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 116 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 169 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 112 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 235 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  26.13 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  28.29 
 
 		 170 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  25.07 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  25.67 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  26.73 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  26 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  28.7 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  26.73 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  48.98 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  22.36 
 
 		 531 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.33 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  21.69 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 220 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 172 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 		 101 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  26.46 
 
 		 541 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.14 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  24 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  23.63 
 
 		 258 aa  51.2  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.48 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 269 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  22.81 
 
 		 521 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 121 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 		 121 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 		 177 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 290 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>